Naprapaten behandler både muskler og ledd innenfor en helhetstenkning der ortopedisk manuell medisin kombineres med en spesifikk kunnskap om kroppens oppbygging via muskler, skjelett, ledd og nervesystem.
Naprapaten behandler spesielt lidelser i ledd, sener og muskler. Innenfor naprapatiens behandlings- system er manipulasjon, mobilisering, massasje, muskeltøyning, artikulering og triggerpunkts - behandling hovedelementene. Disse metodene blir ofte benyttet i kombinasjon for effektivt å behandle muskel - og skjelettplager.